时间分辨光谱学在生物学中的应用

发布时间:2023-11-14 09:39:17

时间分辨光谱学(TRS)是一种功能强大的分析技术,已被广泛应用于各个科学学科。其中,生物学已成为一个大有可为的领域,时间分辨光谱技术为复杂的生物过程提供了宝贵的见解。本文将讨论时间分辨光谱学在生物学中的应用,全面介绍其意义、最新趋势、技术细节和最新研究。

图片来源:Gorodenkoff/Shutterstock.com

时间分辨光谱学的优势
在生物学中,许多重要过程都发生在毫秒、微秒甚至飞秒之间。时间分辨光谱技术可以精确捕捉这些转瞬即逝的瞬间。例如,它可以实时揭示酶反应、光合作用中的电子传递或蛋白质折叠的动力学过程。

此外,时间分辨光谱法不仅限于监测动力学,还能揭示生物分子内的结构变化。这对于研究蛋白质构象变化尤为重要,而蛋白质构象变化在各种疾病中起着至关重要的作用。时间分辨光谱法还能检测 pH 值、离子浓度和温度的变化,从而深入了解这些因素如何影响生化反应。时间分辨光谱技术的另一个重要优势在于药物开发和疾病研究,因为它有助于了解药物如何与其目标分子实时相互作用。例如,它可应用于癌症研究,监测细胞增殖和迁移的动态。

时间分辨光谱学在生物学中的最新发展趋势
最近的发展表明,各种光谱技术与时间分辨光谱技术相结合,可以更全面地了解生物过程。将时间分辨光谱与核磁共振、X 射线晶体学和电子显微镜等其他方法相结合,可以多维度地观察复杂的生物系统。

同样,单分子时间分辨光谱学的发展势头也很猛,它使研究人员能够监测单个分子并详细观察其行为,特别是在研究生物分子相互作用和构象变化方面。

另一个新兴趋势是将超分辨率显微镜与时间分辨光谱相结合,以实现远远超过衍射极限的空间分辨率。这为研究亚细胞结构和细胞过程开辟了新的视野,使研究人员能够直观地看到以前看不到的东西。

最近的趋势也倾向于在体内应用时间分辨光谱技术。这涉及对生物体内的生物过程进行非侵入性监测,使其成为神经科学、药理学和医学诊断等领域的潜在变革者。

时间分辨光谱学在生物学中的工作原理
时间分辨光谱学依赖于物质与电磁辐射之间的相互作用。以超短激光脉冲的形式产生短至飞秒的强光,从而捕捉超快事件。激光脉冲射向生物样本,与样本发生相互作用,引起变化,影响探测光的特性,如波长、偏振或强度。

第二个光脉冲通常称为探测脉冲,用于测量初始脉冲的特性变化。泵浦(激发)脉冲和探针脉冲之间的时间延迟可精确控制。因此,通过分析收集到的数据,可以重建样品特性的时间演变,从而深入了解生物系统中发生的动态过程。

时间分辨光谱学的最新研究
在 2021 年的一项研究中,研究人员探索了时间分辨光谱学在生物学领域的应用,重点是光遗传通道,特别是通道闪烁蛋白(ChRs)和阴离子通道闪烁蛋白(ACRs)。他们研究了天然 ACR(Guillardia theta Anion Channelrhodopsin-1(GtACR1))的光周期,并将其与研究得很透彻的 ChR(Chlamydomonas reinhardtii Channelrhodopsin-2)(CrChR2)进行了比较。这些都是特定类型的蛋白质或通道荧光素。他们采用时间分辨紫外/可见光谱和傅立叶变换红外光谱来监测 GtACR1 光周期中的动态分子过程。

研究发现,GtACR1不存在光适应状态,这使其有别于CrChR2。GtACR1 表现出更高的峰值电流和更低的失活,这归因于它预先存在的隧道和没有同步光周期。这项研究深入揭示了GtACR1通道门控的分子机制及其与CrChR2的不同之处,从而加深了人们对光遗传学工具的设计和在生物学中的应用的理解。

 

时间分辨光谱学的未来前景

时间分辨光谱学在生物学领域的未来前景非常广阔。时间分辨光谱法有望彻底改变复杂的生物过程研究,提供宝贵的见解和应用。随着该领域技术的进步和研究的发展,可以预见到一些令人兴奋的发展,包括时间分辨光谱与核磁共振、X 射线晶体学和电子显微镜等其他先进光谱技术相结合,增强了多模态整合。这种整合将使人们对复杂的生物系统有更全面的了解。

同样,在神经科学、药理学和医学诊断等领域,向体内应用(涉及对生物体内生物过程的非侵入性监测)的转变也蕴含着巨大的潜力。这些进步将共同塑造和增强我们对生物过程的理解,为生物学的研究和应用提供新的途径。

参考资料

Dreier, M. A., Althoff, P., Norahan, M. J., Tennigkeit, S. A., El-Mashtoly, S. F., Lübben, M., ... & Gerwert, K. (2021). Time-resolved spectroscopic and electrophysiological data reveal insights in the gating mechanism of anion channelrhodopsin. Communications Biology. https://doi.org/10.1038/s42003-021-02101-5

Schmitt, M., Dietzek, B., Hermann, G., & Popp, J. (2007). Femtosecond time‐resolved spectroscopy on biological photoreceptor chromophores. Laser & Photonics Reviews. https://doi.org/10.1002/lpor.200710005

Gupta, B. K., Rathee, V., Narayanan, T. N., Thanikaivelan, P., Saha, A., Govind, ... & Ajayan, P. M. (2011). Probing a Bifunctional Luminomagnetic Nanophosphor for Biological Applications: a Photoluminescence and Time‐Resolved Spectroscopic Study. https://doi.org/10.1002/smll.201100441

Masuch, R., & Moss, D. A. (2003). Stopped flow apparatus for time-resolved Fourier transform infrared difference spectroscopy of biological macromolecules in 1H2O. Applied spectroscopy. https://doi.org/10.1366/000370203322554581

作者:Taha Khan

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