研究目的
研究高光谱成像(HSI)结合卷积神经网络(CNN)对甲状腺、气道消化道及口腔正常与癌变组织进行分类的能力,旨在为头颈癌诊疗提供计算机辅助诊断工具。
研究成果
该研究表明,高光谱成像(HSI)结合卷积神经网络(CNNs)能有效区分头颈部正常组织与癌变组织,具有较高的准确率、灵敏度和特异性。将正常组织进一步细分为上皮、肌肉和腺体黏膜的新分类方法显示出额外的诊断潜力。未来研究应采用更大数据集并优化深度学习架构,以提高可靠性和适用性。
研究不足
有限的病例数据集(21例患者)降低了研究结果的普适性。在常规多类别子分类中采用感兴趣区域(ROI)技术勾画目标组织可能引入误差。需要更多患者数据以确立可靠性和普适性。
1:实验设计与方法选择:
本研究招募了21例接受手术切除的头颈癌患者,采集60份切除组织样本(肿瘤组织、正常组织及肿瘤-正常交界区)。通过高光谱成像系统获取组织图像,由病理学家以数字化组织学切片作为金标准进行诊断。采用基于AlexNet架构和改进Inception模块的卷积神经网络(CNN)进行组织分类,模型在TensorFlow框架中实现。
2:样本选择与数据来源:
样本来自呼吸道消化道头颈部鳞状细胞癌患者(7例)和甲状腺组患者(14例,包含良性多结节性甲状腺肿、经典型甲状腺乳头状癌、滤泡型甲状腺乳头状癌及髓样甲状腺癌)。获取高光谱图像并进行预处理后,生成图像块用于CNN训练和测试。
3:实验设备与材料清单:
高光谱成像系统(CRI Maestro成像系统,珀金埃尔默公司),包含氙气白光光源、液晶可调谐滤光片和16位电荷耦合器件(CCD)相机。软件:TensorFlow用于CNN实现,MATLAB用于ROC曲线分析,Aperio ImageScope(徕卡生物系统公司)用于组织学切片数字化。
4:实验流程与操作规范:
组织样本在冷PBS缓冲液中运输,经高光谱扫描后使用暗电流和白参考进行归一化处理,并移除眩光像素。从高光谱数据中创建25×25×91维度的非重叠图像块。采用留一患者交叉验证法训练验证CNN模型,通过ROC曲线、AUC值、准确率、灵敏度和特异度评估性能。
5:数据分析方法:
使用MATLAB构建ROC曲线并计算AUC值、准确率、灵敏度和特异度。CNN分类基于每个图像块的最高概率类别,多分类任务采用决策树方法进行子类划分。
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Hyperspectral Imaging System
CRI Maestro
Perkin Elmer Inc.
Acquiring hyperspectral images of tissue specimens for optical biopsy and classification.
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Software
TensorFlow
Google
Implementing and training convolutional neural networks for tissue classification.
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MATLAB
MathWorks Inc
Constructing receiver operator characteristic (ROC) curves and analyzing classification performance.
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Aperio ImageScope
Leica Biosystems Inc
Digitizing and viewing histology slides for ground truth confirmation by pathologists.
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