在本研究中，提出了一种基于高通量扩展附件傅里叶变换红外（HT-FTIR）光谱结合化学计量学的方法，用于鉴定动物DNA的来源。通过对51个标准DNA样本（25个牛源和26个鱼源）的FTIR光谱峰进行分析，发现了重要的区分特征，包括1710、1659、1608、1531、1404、1375、1248、1091、1060和966 cm−1的峰值。特别是，1708和1668 cm−1的带在鱼DNA中高于牛DNA，而1530 cm−1的带则相反。此外，发现PO2− Vas/Vs比率（1238/1094 cm−1）在牛DNA中显著高于鱼DNA（p < 0.05）。这些区分特征与不同样本的碱基含量和碱基序列密切相关。进行了多变量分析，如主成分分析（PCA）和偏最小二乘判别分析（PLS-DA），PLS-DA模型的灵敏度和特异性值均为1。通过对20个肉组织样本（4个牛源，5个羊源，5个猪源和6个鱼源）的验证，这些样本成功区分开来。本案例研究表明，FTIR光谱结合PLS-DA判别模型可以提供一种快速、灵敏和可靠的动物来源DNA鉴定方法。该方法可广泛应用于食品、饲料、法医学和考古学研究。